Thứ Tư, 11/10/2023, 8:00

Công nghệ Genics Shrimp Multipath: Phát hiện sớm virus Đốm trắng trên tôm

Áp dụng Shrimp MultiPath™ giúp phát hiện sớm và giảm thiểu rủi ro, chống lại virus Đốm trắng và nhiều mầm bệnh khác trên tôm

(Aquaculture.vn) Genics Shrimp MultiPath™ bao gồm xét nghiệm virus gây bệnh Đốm trắng (WSSV) có độ nhạy cao và đặc hiệu, xét nghiệm được 12 mầm bệnh khác. Phát hiện mầm bệnh sớm là một cách để giảm rủi ro, chống lại virus gây bệnh Đốm trắng và nhiều mầm bệnh khác trên tôm.

Áp dụng Shrimp MultiPath™ giúp phát hiện sớm và giảm thiểu rủi ro, chống lại virus Đốm trắng và nhiều mầm bệnh khác trên tôm
Áp dụng Shrimp MultiPath™ giúp phát hiện sớm và giảm thiểu rủi ro, chống lại virus Đốm trắng và nhiều mầm bệnh khác trên tôm

Virus gây bệnh Đốm trắng (WSSV) vẫn là một trong những mầm bệnh gây hại nghiêm trọng cho tôm trên toàn cầu. Loại virus này có khả năng lây truyền cao và lây nhiễm cho tôm với tác động tàn phá ước 1 tỷ USD mỗi năm đối với nghề nuôi tôm toàn cầu.  Chỉ riêng đợt bùng phát ở Úc năm 2016–2017 đã khiến ngành công nghiệp nội địa này thiệt hại 29 triệu USD.

Việc đưa đàn giống chống chịu mầm bệnh đặc hiệu hoặc đặc hiệu với mầm bệnh WSSV đã bước đầu thành công trong việc bắt đầu kiểm soát dịch bệnh.  Tuy nhiên, WSSV tiếp tục gây thiệt hại kinh tế lớn do lây truyền ngang tại các trang trại không đảm bảo các điều kiện an toàn sinh học cần thiết.  Các xét nghiệm chẩn đoán cụ thể và có độ nhạy cao là cần thiết để xác nhận không có WSSV ở tôm khỏe mạnh, giúp người nuôi yên tâm.

Các xét nghiệm này khó ứng dụng tại các ao nuôi hoặc các trang trại bởi chúng không đủ nhạy khi sử dụng trên mô tôm có chứa các chất ức chế PCR khác nhau như chitin.

Thiết lập nghiên cứu

Lộ trình xác thực chứng minh tính phù hợp cho mục đích trong ba giai đoạn

+ Giai đoạn 1: Đánh giá khả năng của một xét nghiệm để phân biệt một mầm bệnh cụ thể với các mầm bệnh khác (độ đặc hiệu phân tích), để nhận ra một lượng nhất định của một mầm bệnh cụ thể (giới hạn phát hiện) và tạo ra kết quả nhất quán với mỗi lần lặp lại (độ lặp lại).

+ Giai đoạn 2: Hiệu suất chẩn đoán xác định tỷ lệ kết quả xét nghiệm dương tính đúng (độ nhạy chẩn đoán) và âm tính đúng (độ đặc hiệu chẩn đoán) trong một quần thể động vật bị nhiễm bệnh.

+ Giai đoạn 3: Khả năng tái tạo chứng tỏ khả năng của xét nghiệm tạo ra kết quả nhất quán từ cùng một mẫu khi thử nghiệm trong các phòng thí nghiệm khác nhau.

Trong nghiên cứu này, xét nghiệm virus Đốm trắng (WSSV) trên tôm MultiPath™ (SMP) của Genics đã được xác thực theo quy trình được mô tả ở trên và được so sánh với hai xét nghiệm PCR định lượng WSSV (qPCR) hiện đang được WOAH và Chính phủ Úc khuyến nghị.

Các mẫu mô của  tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei) được thu từ các ao riêng lẻ ở châu Mỹ Latinh để đại diện cho ba quần thể thử nghiệm độc lập với 99, 100 và 83 con tôm đại diện trong mỗi quần thể.

Kết quả nghiên cứu

Shrimp MultiPath™ WSSV chỉ số xác thực xét nghiệm đã được thiết lập so với các phương pháp WOAH và CSIRO qPCR, với tất cả đều có giới hạn phát hiện (LOD) tương đương ở mức 2,9; 2,8 và 2,4 bản sao virus trên mỗi phản ứng (Bảng 1).

Bảng 1. Số liệu xác thực xét nghiệm của virus Đốm trắng trên tôm
Bảng 1. Số liệu xác thực xét nghiệm của virus Đốm trắng trên tôm

Với >10.000 mẫu được xử lý trên Shrimp MultiPath™ (SMP) hàng năm, độ đặc hiệu phân tích đã được xác định là 100%. SMP WSSV không phản ứng chéo với bất kỳ mầm bệnh nào khác, cũng như không xảy ra bất kỳ sự can thiệp nào khi lây lan sang các loài tôm khác hoặc thậm chí các sinh vật khác (giun cát). Các mầm bệnh đã được xác nhận trong các mẫu không có WSSV bao gồm Parvovirus gan tụy (HPV), virus Hoại tử cơ quan tạo máu và biểu mô (IHHNV), bệnh Hoại tử gan tụy cấp tính (AHPND), Vi bào tử trùng (EHP), virus hội chứng Taura (TSV), virus Hoại tử cơ truyền nhiễm (IMNV), virus gây bệnh ở mang cá (GAV), virus gây bệnh Đầu vàng (YHV), Monodon Baculovirus (MBV), virus Laem-Singh (LSNV) và virus Mourilyan (MoV).

Độ lặp lại của SMP WSSV tương đương với các xét nghiệm CSIRO và WOAH qPCR và nằm dưới mức phạm vi có thể chấp nhận được, mức chênh lệch bốn lần về số lượng bản sao virus giữa các lần lặp lại.

Để xác định hiệu suất chẩn đoán của SMP, một mô hình thống kê đã được sử dụng do không có xét nghiệm tham chiếu, trong đó SMP vượt trội so với các xét nghiệm tiêu chuẩn. Mô hình đã xác định độ nhạy chẩn đoán trung bình cho ba xét nghiệm là 77,2% (WOAH qPCR), 91,6% (CSIRO qPCR) và 94,9% (SMP WSSV).  Các kết quả này có thể so sánh với các chỉ số chẩn đoán đã công bố cho các thử nghiệm qPCR với 76,8% (WOAH qPCR) và 82,9% tương đối thấp hơn (CSIRO qPCR) (Bảng 1). Các giá trị độ đặc hiệu chẩn đoán có thể so sánh được cho cả ba xét nghiệm ở mức xấp xỉ 99,%.

Các chỉ số hiệu suất chẩn đoán cho SMP WSSV đặc biệt tốt và phù hợp với ba trường hợp sử dụng phù hợp với mục đích của WOAH: (1) chứng nhận không bị lây nhiễm hoặc không có sự hiện diện của tác nhân ở từng động vật, (2) xác nhận chẩn đoán nghi ngờ hoặc các trường hợp lâm sàng và (3) ước tính tỷ lệ nhiễm trùng hoặc phơi nhiễm để tạo điều kiện phân tích rủi ro.

Quan điểm

Sự lây lan toàn cầu của các mầm bệnh gây hại cho tôm, cùng với sự xuất hiện của các mối đe dọa mầm bệnh mới, đã khiến ngành nuôi trồng thủy sản phải ưu tiên các tiêu chuẩn cao trong việc phát hiện mầm bệnh sớm và các biện pháp an toàn sinh học. Những mầm bệnh này có thể có tác động tàn phá quần thể tôm, dẫn đến thiệt hại kinh tế đáng kể cho ngành. Phát hiện sớm là chìa khóa để thực hiện các biện pháp kiểm soát hiệu quả và ngăn chặn sự lây lan của các mầm bệnh này.

Công nghệ Shrimp MultiPath™ của Genics cung cấp một nền tảng phát hiện nhiều mầm bệnh thông lượng cao với giá cả phải chăng, bao gồm xét nghiệm WSSV tương đương với các tiêu chuẩn toàn cầu về độ nhạy và độ đặc hiệu của phân tích và chẩn đoán. Do đó, SMP là công cụ lý tưởng để kiểm tra, giám sát hiệu quả và chẩn đoán mục tiêu như một phần của các biện pháp an toàn sinh học cho phép ngành nuôi tôm và các cơ quan chức năng nhận được cảnh báo sớm về các mối đe dọa tiềm ẩn của WSSV trong quần thể tôm toàn cầu.

 Hảo Mai (Theo Globalseafood)